Le staff administratif est composé du Directeur Général, de son adjoint et des chefs de services administratifs.
L’équipe actuelle se présente comme suit :
Directeur Général
Pr. Idrissou ABDOULAYE Directeurr Général Adjoint
Alexandre SOSSOU Chef Service Economique
DOMAH Marcel Chef Service Financier
Chef Service des Ressources Humaines
Chef Service Accueil et Clientèle
Agent Comptable
Chef Service Social
Chef Service Maintenance
Infirmière Générale (...)

La Commission Médicale Consultative (CMC) est composée de tous les chefs de Service et des représentants élus des Médecins et Pharmaciens.
Ses activités sont coordonnées par un bureau constitué de membres élus par leurs pairs

Le Comité d’Etablissement est composé de : Membre Poste Directeur Général Président Directeur Adjoint Membre Chef de Services Administratifs Membre Six (06) Représentants du Personnel Membre Deux (02) Médecins désignés par la CMC Membre Deux (02) Représentants des Surveillants des Services élus par leur pairs Membre

Le Centre National Hospitalier et Universitaire Hubert Koutoukou MAGA CHNU-KM) est administré par un Conseil d’Administration composé de neuf (09) membres :
le Représentant du Ministre en charge de la Santé (Président) ;
le Représentant du Ministre en charge de l’Enseignement Supérieur (Vice-Président)
le Représentant du Ministre en charge des Finances ;
le Représentant du Ministre en charge du Travail ;
le Représentant des Tradithérapeutes élu par ses Pairs ;
le Président de la Commission (...)